L'estensione del file PDB è sinonimo di "protein data bank" e contiene al suo interno testo che descrive la struttura tridimensionale delle proteine molecolari. Esso viene utilizzato per memorizzare le informazioni nella banca di dati della proteina, che è un database sempre crescente che organizza tutte le proteine conosciute. Il tipo di file FASTA è utilizzato da software di analisi del DNA per fare rappresentazioni bidimensionali delle proteine e valutare la loro somiglianza. File PDB possono essere convertiti in file FASTA, in modo che queste rappresentazioni bidimensionale delle proteine possono essere studiate. Le rappresentazioni bidimensionali sono molto più semplice per analizzare e confrontare rispetto alla versione tridimensionale, ed è per questo motivo che i ricercatori a volte preferiscono fare il loro lavoro nel software FASTA.

Istruzioni

1

Scaricare il convertitore sequenza proteica avanzata legata a risorse. Questo è il software disponibile solo che convertirà il file PDB in FASTA.

2

Installare il convertitore di sequenza della proteina avanzata sul vostro computer.

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Aprire il programma avanzato convertitore di sequenza della proteina.

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Fare clic su "File" e poi "Apri File".

5

Seleziona il tuo file PDB dalla finestra del browser che si apre.

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Fare clic su "Apri".

7

Scegliere "Al formato FASTA" nella rubrica "Esportazione" sul lato inferiore destro del programma.

8

Fare clic su "Opzioni" e poi "Impostazioni".

9

Scegliere la lunghezza della stringa in che si preferisce il tuo file FASTA da esportare.

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Fare clic su "OK".

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Fare clic sul pulsante "Esporta". Ora il tuo file PDB si convertirà in un file FASTA con le lunghezze di stringa di proteina che indicato.