Software di deframmentazione migliora le prestazioni di un computer Windows mettendo i cluster file nello spazio contiguo. Windows viene fornito con un proprio programma di deframmentazione, ma sono disponibili anche applicazioni di terze parti.

Nativi di Windows

Tutte le versioni di Windows sono dotate di un'utilità di deframmentazione nativa che può essere trovata in Start > Accessori > sistema. Questa utilità può essere utilizzata in combinazione con Windows Task Scheduler per pianificare la deframmentazione regolare.

Commerciale

Numerose applicazioni di deframmentazione commerciali sono disponibili, tra cui Diskeeper e disco perfetto. Questi programmi utilizzano algoritmi di deframmentazione diverso rispetto l'utilità di Windows nativo e possono essere significativamente più veloci rispetto la deframmentazione di Windows nativa. Caratteristiche e prezzi variano notevolmente fra le applicazioni commerciali, e molti deframmentatori commerciali offrono supporto tecnico.

Open Source

Deframmentatori opensource, tra cui MyDefrag e UltraDefrag, sono disponibili gratuitamente tramite Internet per uso privato e commerciale. Prestazioni sono paragonabile a molti pacchetti commerciali, anche se può variare notevolmente tra le diverse applicazioni. Supporto per ogni applicazione varia ed è fornito dalla comunità open source.